Od dnia 1. stycznia 2013 roku obowiązywać będą dwie stawki VAT - podstawowa 21 % (dotychczas 20 %) oraz obniżona 15 % (dotychczas 14 %).

Należy zwrócić szczególną uwagę na ceny oferowanych usług i sprzedawanego towaru, aby z dniem 1. stycznia zawierały już nową stawkę podatku VAT.

Równocześnie do stawki podstawowej zostały przeniesione niektóre artykuły dziecięce, w tym pieluchy oraz zostały transponowane niektóre nowe zapisy dyrektywy unijnej o VAT.

Ustawa o podatku VAT w nowym brzmieniu zaleca dokonywanie płatności pomiędzy płatnikami VAT tylko poprzez rachunki bankowe, które podatnik zgłosi urzędowi skarbowemu, które będą publiczne. W ten sposób podatnik ograniczy ryzyko konieczności ręczenia za nieodprowadzony podatek przez drugi podmiot.

Ponadto od Nowego Roku odbiorca faktury nie będzie mógł żądać faktury papierowej, jeżeli dostarczona elektronicznie będzie zawierała certyfikat. Do końca 2012 odbiorca miał prawo nie akceptować takich faktur.

Ostatnią ważną zmianą jest zlikwidowanie konieczności rejestracji do podatku VAT w przypadku świadczenia lub przyjmowania usług z innego kraju EU. Do 2012 roku każde transgraniczne świadczenie usług było związane z obowiązkiem rejestracyjnym. Od 2013 roku świadczeniodawca lub świadczeniobiorca nie będą musieli się rejestrować jako podatnicy, a jedynie zgłosić świadczenie w tzw. deklaracji podsumowującej do VAT (zgłoszenie do VIES).