Od 1. ledna 2013 budou platit dvě sazby DPH - základní 21% (dosud 20%) a snížená o 15% (dosud 14%).

Zvláštní pozornost by měla být věnována ceny nabízených služeb a prodaného zboží tak, aby od 1. ledna obsahovaly novou sazbu DPH.

Zároveň byly některé dětské předměty, včetně plenek, převedeny do základní sazby a některé byla transponována nová ustanovení směrnice EU o DPH.

Nové znění zákona o DPH doporučuje provádět platby mezi plátci DPH pouze prostřednictvím bankovních účtů, které poplatník nahlásí finančnímu úřadu, který bude veřejný. Tímto způsobem sníží daňový poplatník riziko, že bude muset za neodvedenou daň zaplatit jiný subjekt.

Kromě toho od nového roku nebude moci příjemce faktury požadovat papírovou fakturu, pokud je doručena elektronicky a obsahuje certifikát. Do konce roku 2012 měl příjemce právo takové faktury nepřijímat.

Poslední důležitou změnou je odstranění nutnosti registrace k DPH v případě poskytování nebo přijímání služeb z jiné EU země. Do roku 2012 podléhalo jakékoli přeshraniční poskytování služeb registračním povinnostem. Od roku 2013 se poskytovatel nebo příjemce služby nebude muset registrovat jako daňoví poplatníci, ale pouze nahlásí výhodu v tzv. Souhrnné přiznání k DPH (prohlášení k VIES).